我國(guó)科學(xué)家日前完成了包羅毛竹葉片、筍和萌發(fā)種子等在內(nèi)的毛竹全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)構(gòu)建，并正確測(cè)定了1萬(wàn)余條基因序列。
這是公共數(shù)據(jù)庫(kù)中繼水稻和擬南芥以外，第三大的植物全長(zhǎng)cDNA數(shù)據(jù)信息資本，第一次提供了大量竹亞科基因序列信息，填補(bǔ)了禾本科植物比較基因組學(xué)研究的一個(gè)空缺，為進(jìn)一步的基因組測(cè)序設(shè)計(jì)提供了有用的基因注釋依據(jù)。
毛竹全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)構(gòu)建和基因序列正確測(cè)定，是“毛竹基因組測(cè)序研究”重大科研項(xiàng)目的第一部門(mén)。該項(xiàng)目由財(cái)政部、科技部支持，國(guó)家林業(yè)局行業(yè)科研專項(xiàng)立項(xiàng)重點(diǎn)支持，中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院林研所、國(guó)際竹藤網(wǎng)絡(luò)中心與中國(guó)科學(xué)院國(guó)家基因研究中心互助肩負(fù)。
科學(xué)家們?cè)谕瓿擅袢L(zhǎng)cDNA文庫(kù)構(gòu)建并正確測(cè)定1萬(wàn)余條基因序列的同時(shí)，還首次根據(jù)毛竹大規(guī)模的基因序列統(tǒng)計(jì)了毛竹基因的一些基本信息，包羅GC含量、密碼子使用偏好性、簡(jiǎn)單重復(fù)序列、小分子RNA和轉(zhuǎn)座子的統(tǒng)計(jì)等。另外，科學(xué)家們根據(jù)判定到的42組禾本科同源基因，舉行了系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分解，分解顯示毛竹與水稻具有最近的進(jìn)化關(guān)系。這對(duì)禾本科植物的進(jìn)一步研究提供了極其重要的信息，對(duì)林業(yè)領(lǐng)域基因組學(xué)研究是一個(gè)重大突破。
同時(shí)，作為大規(guī)模開(kāi)展毛竹基因組測(cè)序的下午性基礎(chǔ)研究工作，科學(xué)家們還順利完成了兩套高質(zhì)量、高覆蓋率的毛竹BAC文庫(kù)構(gòu)建工作，為全面開(kāi)展毛竹基因組測(cè)序研究的各項(xiàng)預(yù)研工作做好了準(zhǔn)備。
毛竹是天下上較重要的竹類植物之一，也是我國(guó)分布范圍較廣、栽植面積較大、經(jīng)濟(jì)價(jià)值較高的竹種，在禾本科植物中占有特殊的職位。而禾本科類植物是人類獲取食物和潛在可再生能源的重要來(lái)源。為了舉行更全面的比較基因組學(xué)的研究，科學(xué)工作者需要不停積累來(lái)自于不同種類的禾本科植物的基因信息和基因組信息?，F(xiàn)在，在公共數(shù)據(jù)庫(kù)中，禾本科的大多數(shù)亞科(跨越100個(gè)種類)都有大量相應(yīng)的基因組信息或表達(dá)信息，只有竹亞科(包羅約1000多個(gè)種類)僅有少量的序列信息。毛竹全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)構(gòu)建的完成和1萬(wàn)余條基因序列的正確測(cè)定填補(bǔ)了這一方面的空缺。