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毛竹基因組序列測序工作全面完成,填補了天下竹類植物基因組學研究空缺,開創(chuàng)了我國林木基因組學研究先河。在北京舉行的“毛竹基因組測序研究”項目成果消息公布會公布了這一消息。
“毛竹基因組測序研究”項目由國際竹藤中心、中國林科院林業(yè)研究所和中國科學院國家基因研究中心等科研單位的科學家配合組織開展,江澤慧教授主持。項目組從2021年開始相關研究工作,采取第二代高通量測序技術,對毛竹舉行全基因組隨機測序,得到了相當于毛竹基因組150倍覆蓋率的原始序列,組裝出高質量的序列草圖?!懊窕蚪M序列草圖”在天下權威生物學雜志——《自然·遺傳學》上在線揭曉,這標志“毛竹基因組測序研究”項目圓滿完成。
毛竹基因組包羅跨越20億個堿基對,是水稻的4.5倍,是高粱的3倍,與玉米相當。鑒于毛竹基因組內(nèi)含有高比例和大片斷的重復序列,項目組科學家們對序列的組裝方式舉行了勇敢改善,經(jīng)過幾十次實驗,終于組裝出覆蓋基因組95%以上地區(qū)的高質量序列草圖,展現(xiàn)了60%的毛竹基因組為重復序列所覆蓋。這是目宿天下上完全使用第二代測序方式測定的、結構較為龐大的高等植物基因組之一,序列組裝的難度甚至跨越了用同樣方式測定的高等動物基因組。與此同時,科學家們還對毛竹重要組織舉行了深度的轉錄組測序,得到了大量基因表達信息,結合先期已經(jīng)揭曉的一萬多條全長cDNA序列,注釋出近3.2萬個高度可靠的毛竹基因,約占毛竹基因總數(shù)的90%。由此成立的基因表達譜,覆蓋了毛竹大部門的自然生長階段,其中包羅了非常少見的毛竹開花時期的基因表達數(shù)據(jù),成為今后基因成果研究的重要基礎性數(shù)據(jù)。
國際竹藤中心主任江澤慧,國家林業(yè)局副局長孫扎根,科技部副部長王偉中,農(nóng)業(yè)部副部長、中國農(nóng)科院院長李家洋出席公布會并講話。中國林科院、國際竹藤中心首席科學家彭鎮(zhèn)華介紹了“毛竹基因組測序研究”項目科研成果。
孫扎根說,我國是竹類植物資本大國,種植和利用歷史悠久?,F(xiàn)有竹子種類、竹林面積、竹產(chǎn)品產(chǎn)量均位居天下首位。經(jīng)過不懈積極,竹產(chǎn)業(yè)已成為許多地方壯大地區(qū)經(jīng)濟和促進農(nóng)民就業(yè)增收的重要途徑,竹子已成為增添森林總量和促進經(jīng)濟社會生長的重要資本,竹文化已成為熏陶人們情操和傳承中華文明的重要載體。毛竹基因組測序研究取得的成果,為竹資本定向培育和高效利用提供了強有力的基礎理論依據(jù)和科技支持,為我國林業(yè)開展重要物種的基因成果、分子育種及其他相關領域的研究奠基了堅實的基礎,為天下竹類及臨近門類植物研究、拓展應用方式積累了經(jīng)驗,對推動我國甚至天下林業(yè)生長具有重大意義和深遠影響。
毛竹屬于禾本科竹亞科植物,是具有較高生態(tài)和經(jīng)濟價值的竹類植物,在禾本科植物中占有特殊的職位。我國有毛竹林面積386萬公頃,占天下森林面積的2%和所有竹類植物面積的72%。毛竹基因組序列測序工作全面完成,第一次說明晰毛竹于5000萬年前從禾本科植物中分化出來,繼而于1000萬年前形成了四倍體,較后演釀成現(xiàn)代二倍體毛竹的進化歷史;第一次從基因組的層面,對包羅快速生長和開花調(diào)控在內(nèi)的毛竹特殊生理歷程的形成和機理舉行了形貌與注釋。這些經(jīng)過分解和提煉發(fā)生的數(shù)據(jù)與基因組序列一起,為毛竹及其他竹類作物的生物學研究奠基了重要的數(shù)據(jù)基礎,將徹底改變以往竹類植物分子生物學研究中,由于缺少參考序列而發(fā)生的研究效率低下和分解誤差較高的事態(tài),具有偉大的科學價值和現(xiàn)實意義。
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