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          我國科學(xué)家得到睡蓮基因組展現(xiàn)早期開花植物進(jìn)化特征

          導(dǎo)讀

          019年世界頂級(jí)期刊《自然》以《睡蓮基因組與開花植物的早期進(jìn)化》為題,在線發(fā)表福建農(nóng)林大學(xué)張亮生課題組獲得藍(lán)星睡蓮的高質(zhì)量基因組的研究論文。張亮生博士是中國園藝學(xué)會(huì)水生植物分會(huì)常務(wù)理事,曾獲得國家林業(yè)和草原局的梁希獎(jiǎng)。由他領(lǐng)銜,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)……

          2021年天下頂級(jí)期刊《自然》以《睡蓮基因組與開花植物的早期進(jìn)化》為題,在線揭曉福建農(nóng)林大學(xué)張亮生課題組得到藍(lán)星睡蓮的高質(zhì)量基因組的研究論文。

          張亮生博士是中國園藝學(xué)會(huì)水生植物分會(huì)常務(wù)理事,曾得到國家林業(yè)和草原局的梁希獎(jiǎng)。由他領(lǐng)銜,南京農(nóng)業(yè)大學(xué)陳飛、福建農(nóng)林大學(xué)碩士生導(dǎo)師張興坦等參加的課題組重要從事園藝植物基因組數(shù)據(jù)挖掘。

          據(jù)張亮生博士介紹,通常睡蓮是指睡蓮目睡蓮科睡蓮屬種的睡蓮,睡蓮屬分5個(gè)亞屬,包羅50多種;廣義的睡蓮包羅睡蓮科所有物種。睡蓮從東北至云南,西至新疆皆有分布;在熱帶和寒帶生于池沼、湖泊等靜水水體中。植物園、公園、小區(qū)的水體里險(xiǎn)些都有睡蓮栽植。睡蓮和荷花在中國甚至全天下都是較重要的水生觀賞花卉,但荷花屬于真雙子葉,與睡蓮親緣關(guān)系不同很遠(yuǎn)?!爸罢f荷花與睡蓮屬于統(tǒng)一類型是誤解,只是它們?cè)谛螒B(tài)上有許多相似之處。睡蓮有50多原生種,而荷花只有兩種,睡蓮具有更強(qiáng)的適應(yīng)性和普遍的分布。”張亮生博士說。

          花色花香是園藝植物非常重要的性狀,其藍(lán)色花瓣在園藝性狀中較受歡迎,了解背后的分子機(jī)制是分子遺傳育種的重要內(nèi)容。睡蓮除了常見花色類型外,尚有藍(lán)色、紫色和各種嵌色系,花香類型亦豐富而且濃郁,是理想的花色花香研究材料。睡蓮基因組研究,不僅助力睡蓮成為早期被子植物的模式植物研究系統(tǒng)及展現(xiàn)早期開花植物進(jìn)化特征,且在花色花香等園藝性狀研究方面做出一定孝順。

          課題組得到藍(lán)星睡蓮的高質(zhì)量基因組,通過系統(tǒng)發(fā)育組分解,顯示睡蓮和無油樟屬于早期被子植物類群,通過基因組和轉(zhuǎn)錄組分解,睡蓮科可能在睡蓮目祖先發(fā)生了一次基因組加倍事件。

          張亮生博士介紹說:睡蓮的ABC基因在各個(gè)花器官中具有普遍的表達(dá)譜,而ABC基因在票據(jù)葉和核心雙子葉中具有嚴(yán)格的表達(dá)模式,注釋早期被子植物的ABC基因可能具有普遍的表達(dá),只是在票據(jù)葉和核心雙子葉中嚴(yán)格表達(dá),是后期進(jìn)化出來的。睡蓮的ABC基因表達(dá)情況可能也注釋了萼片和花瓣沒有真正意義上的分化,與被子植物花的祖先相似。

          睡蓮有花色和花香,研究人員推測(cè)了它們的合成途徑基因。通過比較自然變異的白色花瓣藍(lán)星睡蓮與藍(lán)色花瓣的轉(zhuǎn)錄組,發(fā)現(xiàn)兩個(gè)重要基因可能編碼藍(lán)色花瓣合成途徑下午酶?;ㄇ嗨睾铣赏纺┪蔡焐娘w燕草素是賦予睡蓮藍(lán)色的重要緣故原因。睡蓮的花香有11種不同的芬芳身分,重要是萜類和脂肪酸等,脂肪酸是睡蓮中特有身分,而在單雙子葉植物中沒有發(fā)現(xiàn)。合成倍半萜基因與單雙子葉中已知基因紛歧樣。通過基因表達(dá)分解,發(fā)現(xiàn)一個(gè)基因在花瓣中特于高表達(dá),且這個(gè)基因所編碼的酶在酵母中具有催化脂肪酸的活性,推測(cè)其是脂肪酸合成酶。

          花香身分及其合成基因進(jìn)化分解顯示,睡蓮與核心被子植物是平行進(jìn)化出花香。由于睡蓮怪異的進(jìn)化位置,其基因組展示了早期開花植物的進(jìn)化特征。通過睡蓮基因組發(fā)現(xiàn)基因組加倍和花香的起源對(duì)被子植物的快速輻射具有重要性,展現(xiàn)早期開花植物的花器官發(fā)育可能不是嚴(yán)格受ABC基因調(diào)控。在園藝育種上,藍(lán)色花瓣的合成下午基因的發(fā)現(xiàn)可以作為培育藍(lán)色花瓣花卉的候選基因。

          張亮生博士說:由于睡蓮怪異的進(jìn)化位置,其基因組與轉(zhuǎn)錄組效果展示了早期被子植物的進(jìn)化特點(diǎn)和特征;同時(shí)分解了睡蓮的花器官發(fā)育和花香花色調(diào)控基因,對(duì)園藝植物分子育種等應(yīng)用具有重要參考價(jià)值。

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